稅法優(yōu)先原則：一切判定都要以《增值稅暫行條例》《發(fā)票管理辦法》為底線。比如一般納稅人默認(rèn)適用 9% 稅率，小規(guī)模納稅人適用 3% 征收率，這是法定規(guī)則，不能靠 “口頭約定” 突破；

合同約束原則：如果合同里明確寫了 “結(jié)算稅率按 9% 執(zhí)行”“發(fā)票稅率需與投標(biāo)報價一致”，且沒有補(bǔ)充調(diào)整條款，工程隊擅自開 3% 發(fā)票就屬于違約，審計要站在合規(guī)角度支持甲方追補(bǔ)差額（參考《民法典》第 577 條違約責(zé)任條款）；

實(shí)質(zhì)重于形式原則：不能光盯著票面稅率下結(jié)論。比如工程隊說自己是小規(guī)模納稅人，就得查它有沒有合法的轉(zhuǎn)登記手續(xù)；說項目適用簡易計稅，就得核實(shí)是不是真的 “清包工” 或 “甲供工程”。

合法情況：工程隊年銷售額沒超過 500 萬元，符合《國家稅務(wù)總局公告 2018 年第 18 號》里 “一般轉(zhuǎn)小規(guī)模” 的要求，且已經(jīng)向稅務(wù)機(jī)關(guān)提交《轉(zhuǎn)登記申請表》、拿到備案文件。這種情況下開 3% 發(fā)票合規(guī)，不用審減；

違規(guī)情況：年銷售額超 500 萬，或者沒辦轉(zhuǎn)登記手續(xù)，卻以 “小規(guī)模納稅人” 名義開 3% 發(fā)票。比如某工程隊明明還是一般納稅人，為了少繳稅故意開低稅率，這種情況必須按 9% 稅率核算差額，強(qiáng)制審減。

合同明確 9% 稅率：比如條款寫著 “本項目結(jié)算按 9% 增值稅率計算，發(fā)票稅率需與投標(biāo)報價一致”，工程隊擅自開 3% 發(fā)票就是違約。審計時要支持甲方按 9% 稅率追補(bǔ)差額，甚至追究對方違約責(zé)任；

合同沒提稅率或?qū)?“以實(shí)際開票為準(zhǔn)”：這時要結(jié)合稅法判定。如果工程隊是合法小規(guī)模納稅人（或符合簡易計稅條件），3% 發(fā)票合規(guī)；如果是一般納稅人且不符合簡易計稅條件，就得要求補(bǔ)開 9% 發(fā)票，或按稅率差審減。（參考《最高人民法院關(guān)于審理建設(shè)工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋（二）》）

義務(wù)在身份變更后：比如工程隊 3 月辦了轉(zhuǎn)登記（變小規(guī)模），甲方 4 月才支付進(jìn)度款，這時納稅義務(wù)對應(yīng)小規(guī)模身份，開 3% 發(fā)票沒問題；

義務(wù)在身份變更前：比如甲方 1 月付了預(yù)付款（此時工程隊還是一般納稅人），工程隊 3 月轉(zhuǎn)登記后才開 3% 發(fā)票，這就不合規(guī) —— 納稅義務(wù)發(fā)生在一般納稅人時期，必須開 9% 發(fā)票，否則要審減差額（依據(jù)《增值稅暫行條例》第 19 條）。

索要《轉(zhuǎn)登記申請表》和稅務(wù)備案回執(zhí)，確認(rèn)身份變更合規(guī)；

比對轉(zhuǎn)登記時間（2024 年 3 月）和工程款支付時間（2024 年 4 月），確認(rèn)納稅義務(wù)在變更后；
結(jié)論：3% 發(fā)票合規(guī)，無需審減。

查合同和采購憑證，確認(rèn)項目是 “包工包料”，排除簡易計稅資格；

查稅務(wù)登記記錄，確認(rèn) B 隊仍為一般納稅人，未辦轉(zhuǎn)登記；

算審減金額：不含稅工程造價 1000 萬元 ×（9%-3%）=60 萬元；
結(jié)論：審減 60 萬元，并建議甲方追究 B 隊違約責(zé)任。

若 C 隊是合法小規(guī)模納稅人：3% 發(fā)票合規(guī)，結(jié)算價按 2060 萬元執(zhí)行；

若 C 隊是一般納稅人：需補(bǔ)開 2180 萬元（9% 稅率）發(fā)票，或?qū)彍p 120 萬元（2180-2060）。

收集資料，全面摸底：讓甲乙雙方提供投標(biāo)文件（含稅率明細(xì)）、施工合同（付款 + 稅率條款）、納稅登記證明、轉(zhuǎn)登記文件（如有）、工程款支付憑證（發(fā)票 + 銀行回單）、工程進(jìn)度報告（明確付款節(jié)點(diǎn)）；

核查身份變更合法性：重點(diǎn)看 “年銷售額是否≤500 萬”“有沒有稅務(wù)備案文件”，防止工程隊 “虛假轉(zhuǎn)登記” 避稅；

追溯納稅義務(wù)發(fā)生時間：結(jié)合 “合同約定付款時間、實(shí)際付款時間、工程進(jìn)度”，確定每筆款項的納稅義務(wù)時間，再比對對應(yīng)時期的納稅人身份；

精準(zhǔn)測算審減金額：用公式計算：審減金額 =（投標(biāo)報價含稅金額 ÷1.09）×（9%- 實(shí)際開票稅率） 。如果工程隊享受小規(guī)模納稅人優(yōu)惠（如減按 1% 征收），要額外核查優(yōu)惠期限和條件，調(diào)整稅率差（比如 9%-1%=8%）；

留存證據(jù)，多方協(xié)同：爭議大的項目可聯(lián)合稅務(wù)機(jī)關(guān)（確認(rèn)稅率合規(guī)性）、法律顧問（解讀合同條款）核查；所有資料（問詢記錄、稅務(wù)證明、合同截圖）整理歸檔，確保結(jié)論可追溯。

工程隊風(fēng)險：虛假轉(zhuǎn)登記、違規(guī)開低稅率→可能被認(rèn)定為 “偷稅”，需補(bǔ)稅 + 繳納滯納金（每日萬分之五）+1-5 倍罰款，還會影響企業(yè)信用等級，導(dǎo)致后續(xù)投標(biāo)受限；

甲方風(fēng)險：接受不合規(guī) 3% 發(fā)票→作為一般納稅人的甲方無法抵扣進(jìn)項稅（直接損失 9% 進(jìn)項），甚至可能被認(rèn)定為 “接受虛開發(fā)票”，面臨稅務(wù)調(diào)查；

審計人員風(fēng)險：漏查違規(guī)差異、不按規(guī)定審減→可能被認(rèn)定為 “審計失職”，面臨行業(yè)通報，若造成甲方重大損失，還需承擔(dān)民事賠償。